Tijdens zijn promotieonderzoek aan de Universiteit van Amsterdam bestudeerde Andrew Li Yim het epigenoom van verschillende leukocyten en het verband met de ziekte van Crohn en de verschillende fenotypen daarvan.
In het eerste deel analyseerde Li Yim de verschillende Crohn-geassocieerde biomarkers op het DNA-methyloom in verschillende leukocyten en hoe dit is gerelateerd aan de aanwezigheid van Crohn, de ziekteactiviteit en de respons op medicatie.
In een exploratieve studie naar DNA-methylatie in het perifere bloed bleken vrouwelijke Crohn-patiënten andere gemethyleerde posities te hebben dan personen zonder de ziekte. Voor een aantal posities die geannoteerd zijn aan de inflammatoire genen SP140 en TNF, valideerden Li Yim en collega’s dit signaal. Biologisch gezien lijkt differentiële methylatie voor te komen in genen die geassocieerd zijn met de immuunrespons en inflammatie, wat overeenkomstig is met het fenotype van Crohn.
De Amsterdammers evalueerden ook of DNA-methylatie in het perifere bloed gebruikt kan worden als een prognostisch marker om de respons op anti-TNF te voorspellen. Er bleken voorafgaand aan het starten van de medicatie verschillen te bestaan tussen responders en non-responders. Die verschillen lijken stabiel te blijven na 14 weken. Dit wijst erop dat het effect niet door de tijd of inflammatie wordt beïnvloed.
In het tweede deel van zijn proefschrift beschrijft Li Yim enkele onderzoeken naar de inflammatoire fenotypes van macrofagen.
Bron:
Li Yim AYF. Towards the identification of Crohn’s disease-associated epigenetic biomarkers in leukocytes. Proefschrift, Universiteit van Amsterdam, 2 juni 2022.