Tijdens haar promotieonderzoek aan de Universiteit van Amsterdam heeft Annemarie van de Geer nieuwe inzichten verkregen in de kenmerken van een specifieke aangeboren neutrofiele functiestoornis.
Een aangeboren neutrofieldisfunctie kan bijvoorbeeld ontstaan door chronisch granulomateuze ziekte (CGD). CGD-patiënten hebben autosomaal recessieve of X-gebonden mutaties in één van de genen die coderen voor de eiwitten waaruit het NADPH-oxidasesysteem is opgebouwd. Van de Geer beschrijft de genetische, moleculaire, cellulaire en klinische kenmerken van een nieuw CGD-subtype, p40phox-deficiëntie. Ook heeft ze de effectiviteit van en indicaties voor granulocytentransfusie onderzocht. Ten slotte heeft ze een klinische studie uitgevoerd bij patiënten met ernstige neutropenie door chemotherapie. Ze beoordeelde de waarde van verschillende biomarkers waarmee patiënten met febriele neutropenie en een hoog risico op een infectiegerelateerde IC-opname vroegtijdig kunnen worden geïdentificeerd.